Sistem za hlađenje vodom koristi pumpu za cirkulaciju rashladne tečnosti u toplotnoj cevi i odvođenje toplote. Dio koji apsorbira toplinu na radijatoru se koristi za apsorpciju topline iz CPU-a računala, sjevernog mosta i grafičke kartice. Toplota koju apsorbira dio koji apsorbira toplinu odvodi se na vanjski dio kućišta kroz radijator dizajniran na stražnjoj strani trupa. Drugim riječima, najveća prednost vodenog hlađenja je u tome što se toplina može prenijeti na radijator bez povećanja temperature unutar trupa, umjesto korištenja tekućine za hlađenje kompjuterskih dodataka. Sve dok se učinak hlađenja radijatora za ispuštanje topline koju provodi toplinska cijev u zrak može poboljšati, tihi dizajn se može postići smanjenjem brzine ventilatora radijatora za hlađenje ili usvajanjem dizajna bez ventilatora.
Brzo odvođenje toplote
Još jedna važna prednost vodenog hlađenja je to što tečnost ima veliki toplotni kapacitet i spor porast temperature, što je korisno da se osigura da se CPU neće odmah sagoreti kada dođe do hitnog slučaja na računaru.
Nakon uključivanja računara, temperatura polako raste, dok temperatura vazdušnog hlađenja brzo raste do stabilne vrednosti. Kada CPU ima iznenadne događaje kao što je računanje velikih razmjera, vrhunac može trenutno probiti temperaturnu granicu CPU-a. Vodeno hlađenje može dobro filtrirati ovaj vrh kako bi se osigurala sigurnost CPU-a.